El objetivo principal de la elaboración es la reducción del olor, el sabor y la flatulencia, carecterísticas de la soya. Esto se logra extrayendo de la harina desgrasada los carbohidratos y las sustancias solubles en agua ácida, a pH 2.4, o en alcohol. El residuo, que aún contienen algunas proteínas y los carbohidratos, se denomina suero. De él se extraen las proteínas coagulables y los sólidos solubles deshidratados.
El aislamiento de proteína también se realiza a partir de la harina de soya desgrasada. El diagrama de procesamiento del aislado de proteína es como se muestra a continuación.
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